Năm 2018, tình hình hạn hán của các địa phương trên lưu vực sông Cả không quá khốc liệt như những năm 2015, 2017. Nhưng lại rất cực đoan về lũ lụt, chỉ trong vòng hơn 01 tháng (từ ngày 29/7 đến ngày 05/9) đã xảy ra 4 trận lũ liên tiếp, trong đó hai trận lũ cuối (do bão số 4 và mưa lớn sau bão số 4) có giá trị lưu lượng đỉnh lũ rất lớn, tương đương tần suất 2% (trung bình 50 năm xảy ra 01 lần). Tổng lượng lũ 2 trận lũ cuối lên đên 3,1 tỉ mét khối, gấp hơn 10 lần dung tích phòng lũ của hồ Bản Vẽ (300 triệu mét khối). Vì vậy, khi thực hiện nhiệm vụ cắt, giảm lũ cho hạ du, hồ chứa thủy điện Bản Vẽ chỉ cắt, giảm lũ cho ba trận lũ, đến trận thứ 4 thì dung tích phòng lũ của hồ chứa thủy điện Bản Vẽ đã gần hết nên khả năng cắt, giảm lũ cho hạ du không đáng kể.
Công tác vận hành hồ chứa năm 2018 được thực hiện đúng theo quy định, góp phần thúc đẩy ổn định sản xuất nông nghiệp vùng hạ du trong mùa cạn, hạn chế tối đa thiệt hại cho hạ du vào mùa lũ. Công ty đã thực hiện nghiêm túc các lệnh, ý kiến chỉ đạo của UBND tỉnh Nghệ An, Ban chỉ huy PCTT và TKCN tỉnh Nghệ An trong việc vận hành hồ chứa cấp nước cho hạ du vào mùa cạn, cắt giảm lũ cho hạ du vào mùa lũ.
Mặc dù việc vận hành hồ chứa hoàn toàn đúng quy trình, quy định, tuy nhiên với việc thiên tai quá khốc liệt đã gây thiệt hại nặng nề cho vùng hạ du. Trước tình hình đó, Công ty đã thực hiện hỗ trợ cho địa phương khắc phục hậu quả lũ lụt, tính đến nay, tổng số tiền hỗ trợ cho đồng bào bị thiệt hại do lũ lụt là 4,4 tỉ đồng.
Quy trình vận hành liên hồ chứa trên lưu vực sông Cả ra đời đã góp phần tích cực trong việc định hướng, chỉ đạo điều hành, vận hành hồ chứa thủy điện Bản Vẽ, nhưng cũng đã có một số khó khăn nhất định trong việc vận hành hồ chứa. Vì vậy, Công ty thủy điện Bản Vẽ thông qua Hội nghị đã đề nghị Ban chỉ huy PCTT và TKCN tỉnh Nghệ An tham mưu, đề xuất Thủ tướng Chính phủ sớm sửa đồi Quy trình vận hành liên hồ chứa trên lưu vực sông Cả cho phù hợp với thực tế. Công tác vận hành hồ chứa đòi hỏi cần sự phối hợp tốt hơn nữa chính quyền đại phương các cấp, đặc biệt là công tác chỉ đạo, điều hành của Ban chỉ huy PCTT và TKCN tỉnh Nghệ An trong vận hành hồ chứa chống lũ cho hạ du. Cũng thông qua Hội nghị, Công ty đã đề nghị UBND huyện Tương Dương, UBND các xã vùng hạ du tạo điều kiện, phối hợp với công ty để tổ chức các đợt tuyên truyền, truyền thông đến người dân vùng hạ du để người dân hiểu đúng về thủy điện Bản Vẽ, từ đó chia sẻ khó khăn cho công ty trong việc vận hành hồ chứa cũng như có các biện pháp ứng phó khi thủy điện Bản Vẽ xả lũ.
Năm 2019, để chủ động trong công tác phòng, chống, ứng phó kịp thời, hiệu quả, hạn chế mức thấp nhất thiệt hại do thiên tai, đặc biệt là bão, áp thấp nhiệt đới, xả lũ hồ chứa. Góp phần thực hiện thắng lợi mục tiêu, nhiệm vụ sản xuất kinh doanh năm 2019. Công ty đã ban hành kế hoạch phòng chống thiên tai, và bám sát kế hoạch để triển khai thực hiện.